João Paulo Botto Sousa exerce, desde 2 de setembro de 2025, funções como presidente do Conselho Diretivo da Côa Parque – Fundação para a Salvaguarda e Valorização do Vale do Côa, entidade responsável pela gestão do Museu do Côa e do Parque Arqueológico do Vale do Côa.

Designado pela ministra da Cultura, Juventude e Desporto, Margarida Balseiro Lopes, para um mandato de cinco anos, João Paulo Sousa desempenhava anteriormente funções como vogal não executivo da Fundação e presidente da Câmara Municipal de Vila Nova de Foz Côa, cargo autárquico que ocupava desde 2021.